การคัดกรองเสมือนจริง

การตรวจคัดกรองเสมือนจริง (VS) เป็นเทคนิคการคำนวณที่ใช้ในการค้นพบยาเพื่อค้นหาไลบรารีของโมเลกุลขนาดเล็ก เพื่อระบุโครงสร้างเหล่านั้นที่มีแนวโน้มมากที่สุดที่จะจับกับเป้าหมายของยา ซึ่งโดยทั่วไปคือตัวรับโปรตีนหรือเอนไซม์ เมื่อเปรียบเทียบกับการคัดกรองปริมาณงานสูงเชิงทดลองแบบดั้งเดิม (HTS) VS เป็นวิธีการค้นพบยาที่ตรงประเด็นและมีเหตุผลมากกว่า และมีข้อดีของการคัดกรองที่มีต้นทุนต่ำและมีประสิทธิภาพ สามารถใช้ Virtual Screening ในการศึกษาย้อนหลังหรือการศึกษาในอนาคตได้

ในการศึกษาในอนาคต เทคนิค VS ให้วิธีการที่รวดเร็วและประหยัดสำหรับการค้นพบตัวออกฤทธิ์ใหม่โดยการเลือกสารประกอบฐานข้อมูลขนาดใหญ่สำหรับการคัดกรอง (การยืนยันจากการทดลอง) นอกจากนี้ สำหรับบริษัทขนาดเล็กที่ไม่มีการเข้าถึงทรัพยากรการคัดกรองปริมาณงานสูง (HTS) เป็นประจำ วิธีการดังกล่าวมีความสำคัญอย่างยิ่งในการเลือกโมเลกุลสำหรับการคัดกรองภายใน การปรับแต่งและการเพิ่มประสิทธิภาพของวิธีการเชื่อมต่อปริมาณงานสูงได้นำไปสู่การปรับปรุงในการสร้างข้อมูลการทดลองซ้ำและอัตราการเข้าชมที่ได้รับ ตรวจสอบการใช้งานในการระบุการเข้าชม อัตราการเข้าชมโดยทั่วไปจาก HTS ทดลองสามารถอยู่ในช่วงระหว่าง 0.01% ถึง 0.14% ในขณะที่อัตราการเข้าชมสำหรับการคัดกรองเสมือนในอนาคตโดยทั่วไปจะอยู่ระหว่าง 1% ถึง 40%

TargetMol มีจุดแข็งในการออกแบบยาโดยใช้คอมพิวเตอร์ช่วย (CADD) ซึ่ง TargetMol สามารถคำนวณโครงสร้างโปรตีนด้วยความแม่นยำและรวดเร็วโดย AlphaFold2 และให้บริการคัดกรองเสมือนจริงตามโครงสร้างของเป้าหมายหรือโมเลกุลขนาดเล็กกับฐานข้อมูลเคมีของเราเพื่อเลือกสารประกอบที่มีศักยภาพด้วย มีโอกาสสูงที่จะใช้งานในการทดสอบเชิงทดลองในภายหลัง

ประเภทของบริการคัดกรองเสมือนจริงที่มีอยู่

[หีบเพลง]
[ชื่อหีบเพลง =”การคัดกรองเสมือนที่ใช้การเชื่อมต่อระดับโมเลกุล”]

การเชื่อมต่อระดับโมเลกุลเป็นเครื่องมือสำคัญในอณูชีววิทยาเชิงโครงสร้างและการออกแบบยาโดยใช้คอมพิวเตอร์ช่วย การเทียบท่ามีจุดมุ่งหมายเพื่อทำนายโหมดการจับและความสัมพันธ์ของโมเลกุลขนาดเล็กภายในตำแหน่งจับของเป้าหมายตัวรับที่สนใจ สนับสนุนนักวิจัยในการทำความเข้าใจคุณสมบัติหลักทางเคมีกายภาพที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการจับ วิธีการเชื่อมต่อทำให้ลิแกนด์พอดีกับตำแหน่งการจับโดยการรวมและปรับตัวแปรให้เหมาะสม เช่น steric, hydrophobic และ electrostatic Complementarity และยังประมาณค่าพลังงานอิสระในการจับ (การให้คะแนน) เพื่อทำนายโหมดการจับทดลองและความสัมพันธ์ของโมเลกุลขนาดเล็กภายในตำแหน่งจับของตัวรับเฉพาะ เป้าหมาย การเทียบท่าสามารถใช้เพื่อทำการคัดกรองเสมือนจริงในไลบรารีสารประกอบขนาดใหญ่ จัดอันดับผลลัพธ์ และเสนอสมมติฐานเชิงโครงสร้างว่าลิแกนด์ยับยั้งเป้าหมายอย่างไร ซึ่งมีประโยชน์อย่างมากในการเพิ่มประสิทธิภาพลีด การคัดกรองเสมือนจริงโดยใช้การเชื่อมต่อระดับโมเลกุล (DBVS) ได้กลายเป็นเครื่องมือที่สำคัญและจำเป็นมากขึ้นสำหรับการค้นพบยา การประยุกต์ใช้ DBVS ได้นำไปสู่การระบุสารประกอบออกฤทธิ์ใหม่จำนวนมากที่มีเอนทิตีระดับโมเลกุลใหม่

โดยปกติเราจะใช้ขั้นตอนการคัดกรอง 3 รอบเพื่อให้แน่ใจว่าผลลัพธ์ถูกต้อง: 1). การตรวจหาสารเสพติด 2) การคัดกรองเสมือนบนฐานเชื่อมต่อ; 3). การตรวจคัดกรองโดยนักวิทยาศาสตร์ผู้มีประสบการณ์ในการค้นคว้ายา

การคัดกรองแบบแมนนวลคือการเลือกการตีที่มีความเกี่ยวข้องในการจับสูงโดยอิงตามคะแนนการเทียบท่าระดับโมเลกุล ในขณะที่พิจารณาลักษณะโครงสร้าง 3 มิติ (พันธะไฮโดรเจน คุณสมบัติไม่ชอบน้ำ และชอบน้ำ ฯลฯ) ของตำแหน่งการจับตัวยา ในการอ้างอิงถึงความสัมพันธ์ของกิจกรรมโครงสร้างของยาที่มีอยู่ มีการพยายามรักษาปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลที่สำคัญและอนุรักษ์นิยมไว้ รวมทั้งขยายสารประกอบโครงสร้างหลักที่แปลกใหม่เข้าไปในรายการ จากนั้นจะทำการวิเคราะห์กลุ่มเพื่อเลือกความนิยมสูงสุดสำหรับการทดสอบเชิงทดลองในภายหลัง

[/หีบเพลง]

[ชื่อหีบเพลง =”การคัดกรองเสมือนที่ใช้เภสัชตำรับ”]

Pharmacophore-based virtual screening (PBVS) เป็นการออกแบบยาที่ใช้ลิแกนด์ ปัจจุบันเป็นเทคโนโลยีที่พัฒนาแล้ว และได้รับการยอมรับเป็นอย่างดีในห้องปฏิบัติการเคมียา โดยพื้นฐานแล้ว แนวคิดหลักอยู่บนพื้นฐานของการสร้างแบบจำลองทางเภสัชกรรมซึ่งเป็น 'ส่วนประกอบของสเตอริกและอิเล็กทรอนิกที่จำเป็นเพื่อให้แน่ใจว่ามีปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลระดับสูงสุดกับโครงสร้างเป้าหมายทางชีวภาพที่เหมาะสมที่สุด และเพื่อกระตุ้น (หรือขัดขวาง) การตอบสนองทางชีวภาพ' เนื่องจากลักษณะนามธรรมและความเรียบง่าย โมเดลเภสัชภัณฑ์ 3 มิติจึงเป็นตัวแทนของตัวกรองที่มีประสิทธิภาพสำหรับการคัดกรองเสมือนของไลบรารีสารผสมขนาดใหญ่ โดยปกติแล้ว PBVS จะใช้เป็นแนวทางเสริมของ DBVS สำหรับฐานข้อมูลก่อนการประมวลผล (ไลบรารี) ของโมเลกุลขนาดเล็กเพื่อกำจัดสารประกอบที่ไม่มีคุณสมบัติที่ทราบกันดีว่าจำเป็นสำหรับการจับหรือสำหรับสารประกอบหลังการกรองที่เลือกโดยวิธีการเทียบท่า

ในระหว่างการดำเนินการ PBVS แบบจำลองเภสัชจลนศาสตร์ที่ใช้ร่วมกันถูกสร้างขึ้นจากโครงสร้างเชิงรุกของโมเลกุลขนาดเล็กเชิงรุก 1 ตัวหรือหลายตัวที่ลูกค้าให้มา จากนั้นแบบจำลองเภสัชจลนศาสตร์นี้จะถูกคัดกรองกับคลังสารเคมีขนาดใหญ่ และการทำแผนที่โมเลกุลของแบบจำลองจะถูกรวบรวมในรายการที่ได้รับความนิยมเสมือนจริง โมเลกุลเหล่านี้ตอบสนองความต้องการของแบบจำลองและมีความเป็นไปได้สูงที่จะใช้งานในการทดสอบเชิงทดลอง ซอฟต์แวร์บางตัวสำหรับการทำแผนที่เภสัชจลนศาสตร์สามารถให้วิธีการทำนายเชิงปริมาณของกิจกรรม เช่น แบบจำลองเภสัชจลนศาสตร์ 3 มิติ QSAR

[/หีบเพลง]

ความได้เปรียบในการคัดกรองเสมือน Targetmol

• มืออาชีพ ทีม: Targetmol มีทีมคัดกรองที่มีประสบการณ์มากกว่า 10 ปีในการพัฒนายาคำนวณ เพื่อให้มั่นใจในความน่าเชื่อถือและความเป็นมืออาชีพของผลการคัดกรองเสมือนจริง
• ห้องสมุดผสมมากมาย: สารทึบกว่า 20,000 ชนิด กระจายอยู่ในคลังสารมากกว่า 170 แห่ง เพื่อตอบสนองความต้องการของลูกค้าที่แตกต่างกัน
• การแข่งขันราคา: แต่ละเป้าหมายและการเชื่อมต่อระดับโมเลกุลมีค่าใช้จ่ายน้อยกว่า 0.01 ดอลลาร์!
• บริการหลังการขายที่สมบูรณ์แบบ:
• ซื้อสารประกอบเชิงบวกอย่างรวดเร็ว ให้บริการทดสอบกิจกรรม